70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4250 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 363 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  88.98 
 
 		 363 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  82.97 
 
 		 370 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  56.9 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  52.39 
 
 		 353 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  52.78 
 
 		 366 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.21 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.83 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.88 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.72 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  35.52 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.31 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  38.2 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  31.48 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.6 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.06 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  34.41 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  32.15 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.49 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.95 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  32.22 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.73 
 
 		 423 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.12 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  31.47 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.51 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.53 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.55 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  30.75 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  27.06 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.89 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.4 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.61 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.27 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  31.11 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  33.43 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.28 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.7 
 
 		 349 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  25.27 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  25.27 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  32.23 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  25.36 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  26.62 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.95 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  25.75 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.75 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.75 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.75 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.48 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.75 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.23 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.72 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  31.9 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.87 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.58 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.21 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.83 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  33.57 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  33.94 
 
 		 180 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  31.52 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.43 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.86 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  29.41 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  32.14 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>