297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4239 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  81.13 
 
 		 213 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  71.77 
 
 		 212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  66.98 
 
 		 213 aa  286  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  63.29 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  64.25 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  72.86 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  60.39 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  63.46 
 
 		 210 aa  254  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  60.39 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  61.95 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  67.31 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  66.15 
 
 		 202 aa  240  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  60 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  62.8 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  48.1 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  46.6 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  46.8 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  40.74 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  41.33 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  40.21 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  40.74 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  39.15 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  48.47 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  47.5 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  41.12 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  41.12 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  44.27 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  42.78 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  45.21 
 
 		 474 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  41.67 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  42.71 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  41.5 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  43.35 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  38.29 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  38.29 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  38.95 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  37.14 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  36.14 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  32.35 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  33 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  34.73 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  38.55 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  38.3 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 242 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  34.65 
 
 		 242 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  36.53 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  38.95 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  34.42 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  40.49 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  34.33 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  34.33 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 242 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.59 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  35.8 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.14 
 
 		 646 aa  87.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  40.12 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  35.88 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  35.58 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  37.8 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.76 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  36.05 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  36.05 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  36.05 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  34.97 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.69 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  40.83 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  31.36 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  38.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.88 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  37.88 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  31.88 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  33.64 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.58 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  33.17 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  32.3 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.57 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  41.67 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>