144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4228 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  81.38 
 
 		 545 aa  848    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 535 aa  1086    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  74.27 
 
 		 519 aa  781    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  46.27 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  44.13 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  43.71 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  43.05 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  43.86 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  45.03 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  44.13 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  45.69 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  45.58 
 
 		 516 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  43.98 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  43.31 
 
 		 529 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  46.79 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  44.4 
 
 		 529 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  42.43 
 
 		 563 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  45.54 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  43.81 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  41.4 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  42.91 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  40.15 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  41.35 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  43.91 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  41.32 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  43.42 
 
 		 523 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  40.92 
 
 		 530 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.25 
 
 		 552 aa  355  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  42.56 
 
 		 618 aa  353  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  43.51 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  41.44 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  41.89 
 
 		 538 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  42.53 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  42.36 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  40.48 
 
 		 523 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  40.64 
 
 		 538 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  40.9 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  41.15 
 
 		 522 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  41.99 
 
 		 523 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  41.3 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  41.34 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  41.14 
 
 		 534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  40.7 
 
 		 534 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  42.28 
 
 		 524 aa  319  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  38.97 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  41.02 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  37.27 
 
 		 531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  38.6 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  38.17 
 
 		 544 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  41.88 
 
 		 529 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.01 
 
 		 555 aa  259  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  35.36 
 
 		 540 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  33.51 
 
 		 576 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  36.08 
 
 		 541 aa  256  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  35.27 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  35.66 
 
 		 532 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  33.04 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  33.04 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  34.3 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.81 
 
 		 564 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  30.83 
 
 		 674 aa  229  9e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  35.14 
 
 		 523 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  30.95 
 
 		 588 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  33.9 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  30.95 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  32.24 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  30.95 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  30.95 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  31.74 
 
 		 450 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  32.99 
 
 		 583 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  30.23 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  31.35 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  30.34 
 
 		 588 aa  220  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  34.4 
 
 		 596 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 585 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  30.6 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  31.5 
 
 		 575 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  31.9 
 
 		 550 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  29.8 
 
 		 641 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  31.43 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  29.17 
 
 		 589 aa  203  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  31.25 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  30.23 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  31.46 
 
 		 589 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  31.03 
 
 		 589 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  29.89 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  28.98 
 
 		 582 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  32.38 
 
 		 590 aa  183  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  29.37 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.79 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 		 670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  29.97 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  35.85 
 
 		 622 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  26.94 
 
 		 714 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  29.82 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  52.48 
 
 		 209 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  28.84 
 
 		 539 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 539 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>