More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4185 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  100 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  81.54 
 
 		 130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  71.88 
 
 		 129 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  64.89 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  61.07 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  61.07 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  60.31 
 
 		 131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  56.8 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  51.64 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  41.86 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  39.52 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  42.62 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  39.37 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  38.4 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  38.58 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  40.8 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  38.28 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  37.69 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  38.17 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  36.8 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  42.62 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  36.51 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  38.26 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  33.85 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.97 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  45.83 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.8 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 		 389 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.83 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.02 
 
 		 388 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.74 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.61 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 361 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.26 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.98 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  37.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  39.8 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  31.75 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.45 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  25.38 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.81 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  34.34 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  42.25 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.04 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  33.02 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.19 
 
 		 378 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  32.29 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.68 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  34 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  35.51 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  35.29 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>