168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4140 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  92.68 
 
 		 246 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  88.28 
 
 		 249 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  81.67 
 
 		 246 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  46.19 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  37.77 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  36.55 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.08 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  33.19 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  31.48 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  33.19 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  33.33 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  34.23 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  34.23 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  34.23 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  30.74 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  33.18 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  33.78 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  33.16 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  33.78 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  32.87 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  32.56 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  31.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  31.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  31.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  33.33 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  28.7 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  30.36 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  29.44 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  33.02 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  35.61 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  31.47 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  29.6 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  33.84 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  26.5 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  33.18 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.7 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  27.83 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  28.33 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  28.77 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  28.63 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  28.63 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  28.3 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  31.31 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.1 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  27.68 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.17 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.64 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.64 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  26.39 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.64 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  26.64 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  26.17 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  27.52 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.32 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.47 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  27.41 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  31.18 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  25.42 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.71 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  26.63 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  27.75 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  31.18 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  23.98 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  27.83 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  28.43 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  25.58 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  27.62 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  27.43 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  28.96 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  26.81 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  25.93 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  26.44 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  27.37 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26.92 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  25.99 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  27.31 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  27.35 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  27.98 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  27.37 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  26.11 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  26.42 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  26.42 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  25.74 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  27.43 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  25.49 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.23 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.78 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  28.98 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  26.32 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  27.31 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  25.88 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  28.19 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  25.34 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  30.21 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  27.13 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  28.22 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  23.4 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000903381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  21.11 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>