242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4071 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  88.78 
 
 		 205 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  86.83 
 
 		 205 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  81.46 
 
 		 208 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  73.27 
 
 		 207 aa  320  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  64.71 
 
 		 205 aa  277  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  63.18 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  63.68 
 
 		 209 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  62.14 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  62.07 
 
 		 209 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  61.65 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  61.69 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  61.69 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  61.88 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.9 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  57.56 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  60.7 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  58.91 
 
 		 202 aa  257  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  61.19 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  58.33 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  60.3 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  60.3 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  59.31 
 
 		 208 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  60.3 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  61.31 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.3 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  60.3 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  58.79 
 
 		 209 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  57.71 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  58.82 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  57.64 
 
 		 209 aa  249  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  57.64 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  60.3 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  58.25 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  58.82 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  58.25 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  58.25 
 
 		 208 aa  247  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  58.25 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  57.77 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  57.92 
 
 		 221 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  58 
 
 		 209 aa  240  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  54.63 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  55.45 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  55.56 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  54.77 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  53.69 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  52.71 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  51.74 
 
 		 184 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  50.75 
 
 		 202 aa  204  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  48.77 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49.51 
 
 		 202 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  49.5 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  45.73 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  66.41 
 
 		 140 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  45.36 
 
 		 200 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  45.96 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.39 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.83 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  45.92 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  45.79 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  45.79 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.79 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 194 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  44.5 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.22 
 
 		 194 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.22 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  45.36 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  41.54 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  44.17 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  42.93 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.33 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  41.67 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  45.21 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  39.34 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  39.81 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  39.81 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  37.82 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  36.89 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.15 
 
 		 295 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.92 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  43.14 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.32 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.1 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  38.28 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.11 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.35 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.89 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.7 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  32.98 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.52 
 
 		 219 aa  117  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  36.02 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  41.57 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.5 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  37.95 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>