More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4026 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  91.56 
 
 		 550 aa  999    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  62.09 
 
 		 552 aa  670    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  91.27 
 
 		 553 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  83.3 
 
 		 552 aa  908    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  100 
 
 		 557 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.14 
 
 		 548 aa  907    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  62.91 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  59.86 
 
 		 550 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  58.99 
 
 		 541 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  55.72 
 
 		 532 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  54.14 
 
 		 545 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  61.26 
 
 		 549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  55.18 
 
 		 556 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  57.66 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  55.35 
 
 		 585 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  54.17 
 
 		 539 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  57.41 
 
 		 540 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  55.51 
 
 		 552 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  57.17 
 
 		 534 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  55.13 
 
 		 554 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  55.09 
 
 		 540 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  55.2 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  55 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  56.69 
 
 		 538 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  54.42 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  54.43 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  54.3 
 
 		 549 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  52.5 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 		 547 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  52.6 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  52.43 
 
 		 552 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  52.43 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.72 
 
 		 540 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  56.79 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  52.68 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  53.99 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  50.09 
 
 		 542 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.53 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.95 
 
 		 612 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  48.3 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.34 
 
 		 555 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.17 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.58 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.19 
 
 		 619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.41 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.72 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.39 
 
 		 586 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  46.63 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.93 
 
 		 617 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  48.03 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.4 
 
 		 543 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.42 
 
 		 626 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  48.04 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.43 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.47 
 
 		 575 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  47.25 
 
 		 593 aa  465  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.33 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.2 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.09 
 
 		 586 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.2 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.63 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  47.54 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 625 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.44 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.87 
 
 		 640 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.09 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  46.8 
 
 		 542 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  48.03 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.51 
 
 		 625 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.28 
 
 		 613 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  46.62 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 543 aa  458  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  45.75 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.65 
 
 		 606 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  45.56 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.58 
 
 		 562 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.63 
 
 		 629 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  47.7 
 
 		 588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.92 
 
 		 539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.3 
 
 		 633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  48.31 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.71 
 
 		 624 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  48.46 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.42 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 		 633 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  45.37 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 536 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.73 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.26 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.79 
 
 		 596 aa  452  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  45.62 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.44 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  44.89 
 
 		 601 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>