More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3917 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  90.41 
 
 		 271 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.82 
 
 		 271 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  77.39 
 
 		 274 aa  407  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.09 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.43 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.94 
 
 		 662 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.97 
 
 		 661 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.67 
 
 		 662 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.18 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.74 
 
 		 659 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.63 
 
 		 662 aa  158  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.68 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>