More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3875 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  88.58 
 
 		 287 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.87 
 
 		 286 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  73.76 
 
 		 284 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.36 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  71.38 
 
 		 291 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  71.17 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.61 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.46 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.79 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.63 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.12 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.09 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.3 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.43 
 
 		 276 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.94 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.6 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.16 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.36 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.64 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.24 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.31 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.22 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.61 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.61 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.71 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.07 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.68 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.13 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.77 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.3 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.92 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.92 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.18 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.2 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.2 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.91 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.45 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.18 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.79 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.78 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.72 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.76 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.9 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.67 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.72 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.86 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.86 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.12 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.71 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.12 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.72 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.34 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.34 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 		 269 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.65 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.35 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.29 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.91 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.81 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.25 
 
 		 296 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.96 
 
 		 266 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.24 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.01 
 
 		 264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.83 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.6 
 
 		 276 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.05 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.66 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.05 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.76 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>