20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3784 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  99.55 
 
 
220 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  91.82 
 
 
220 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  92.73 
 
 
220 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  75.34 
 
 
216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  63.06 
 
 
218 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  49.11 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  36.15 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  53.1 
 
 
145 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  54.64 
 
 
143 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  46.4 
 
 
145 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  59.04 
 
 
96 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  51.55 
 
 
143 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  56.63 
 
 
96 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  54.22 
 
 
96 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  51.81 
 
 
97 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  61.64 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  64.41 
 
 
66 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  33.82 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  37.21 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>