19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3778 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  86.67 
 
 		 150 aa  273  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  81.08 
 
 		 149 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  65.33 
 
 		 152 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  34.06 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  34.06 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  37.04 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  29.23 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  28.12 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  25.83 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  25.78 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  27.91 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  25.36 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  27.68 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  26.76 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>