More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3639 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3211  regulatory protein ArsR  66.12 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  62.61 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  66 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  57.89 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  59.13 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  63.79 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  60.95 
 
 		 113 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.18 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  56.36 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.27 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  51.24 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  59 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  52.21 
 
 		 118 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  52.42 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  57 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 108 aa  95.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  42.11 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  44.79 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  44.79 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  48.31 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  75.61 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  39 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  41.05 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>