25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3472 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  82.35 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  67.53 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  60.81 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  57.33 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  54.32 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  54.22 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  54.32 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  53.16 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  41.46 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5516  hypothetical protein  27.03 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  38.55 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  36.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  34.25 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>