156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3411 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  81.59 
 
 		 1111 aa  1688    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  61.85 
 
 		 1180 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1130 aa  2184    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  70.96 
 
 		 987 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  45.35 
 
 		 2407 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  69.84 
 
 		 1081 aa  839    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  58.23 
 
 		 814 aa  625  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  51.81 
 
 		 1019 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.41 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  50.5 
 
 		 1078 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  52.04 
 
 		 907 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.37 
 
 		 1532 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  38.18 
 
 		 1177 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  37.3 
 
 		 678 aa  222  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.75 
 
 		 1322 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  36.45 
 
 		 1458 aa  171  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.35 
 
 		 1001 aa  155  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  29.6 
 
 		 983 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.95 
 
 		 1001 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  33.39 
 
 		 1119 aa  147  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  37.64 
 
 		 1971 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  34.26 
 
 		 1459 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1881 aa  132  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  51.88 
 
 		 190 aa  131  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 		 2365 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 		 2346 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.93 
 
 		 2366 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  27.53 
 
 		 1508 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.76 
 
 		 1285 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 		 4238 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.54 
 
 		 1848 aa  116  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  48.43 
 
 		 1055 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.42 
 
 		 1489 aa  113  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  35.55 
 
 		 1741 aa  112  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  27.54 
 
 		 991 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 1782 aa  111  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.37 
 
 		 2396 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.43 
 
 		 3391 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1550 aa  110  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.79 
 
 		 919 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.94 
 
 		 1029 aa  108  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 2371 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.7 
 
 		 3822 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.19 
 
 		 3629 aa  107  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.7 
 
 		 995 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.57 
 
 		 950 aa  105  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  27.1 
 
 		 2003 aa  105  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 1333 aa  104  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36.25 
 
 		 4238 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.8 
 
 		 1056 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1530 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.18 
 
 		 2906 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  46.15 
 
 		 1028 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  23.64 
 
 		 1519 aa  101  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 		 1769 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  26.24 
 
 		 986 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.23 
 
 		 1011 aa  95.5  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.94 
 
 		 1227 aa  95.1  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.43 
 
 		 1694 aa  94.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  44.23 
 
 		 1033 aa  93.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 		 1164 aa  92.8  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  45.91 
 
 		 1038 aa  92  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  42.47 
 
 		 995 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  25.31 
 
 		 677 aa  89.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  32.48 
 
 		 1172 aa  88.6  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.25 
 
 		 1593 aa  87.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  49.17 
 
 		 1053 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  41.67 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1325 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.94 
 
 		 3420 aa  84.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.2 
 
 		 1179 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.94 
 
 		 3415 aa  84  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  32.82 
 
 		 1113 aa  82.8  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.69 
 
 		 985 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.73 
 
 		 3506 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.4 
 
 		 1125 aa  81.6  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.18 
 
 		 1156 aa  81.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  21.58 
 
 		 4248 aa  81.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.84 
 
 		 2363 aa  78.2  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  48.42 
 
 		 1861 aa  76.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  25.83 
 
 		 1016 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  34.38 
 
 		 2711 aa  75.5  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  38.2 
 
 		 3322 aa  75.5  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  42.04 
 
 		 1004 aa  75.5  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  31.62 
 
 		 2926 aa  75.1  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.43 
 
 		 1012 aa  75.1  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.34 
 
 		 861 aa  74.3  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.18 
 
 		 2578 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  47.27 
 
 		 1882 aa  72  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1152 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.68 
 
 		 3089 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.44 
 
 		 1055 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.96 
 
 		 972 aa  70.1  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.16 
 
 		 1134 aa  69.7  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  38.69 
 
 		 1099 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  38.46 
 
 		 990 aa  67  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 1571 aa  67.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  29.18 
 
 		 852 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  35.36 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  36.08 
 
 		 1115 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>