More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3297 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  95.27 
 
 		 296 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  94.26 
 
 		 309 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  88.51 
 
 		 296 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  68.98 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  62.03 
 
 		 294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  61.49 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.82 
 
 		 297 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 		 289 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  56.23 
 
 		 290 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  62.59 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  59.8 
 
 		 293 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  60.34 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  56.57 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.96 
 
 		 282 aa  308  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.54 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.13 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 288 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  44.16 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  44.16 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  39.36 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.73 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.83 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  37.72 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.87 
 
 		 275 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 264 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.07 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  37.54 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 		 263 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.86 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 264 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.97 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.04 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>