More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3292 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 		 404 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  77.92 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  67.74 
 
 		 398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  61.54 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  63.84 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  67.25 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  61.4 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  42.47 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  44.11 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  38.02 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  40.35 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  39.7 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  42 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  39.71 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  40.15 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  42.04 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  42.78 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  39.46 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  38.44 
 
 		 384 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  37.72 
 
 		 399 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  41.5 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  37.99 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  35.99 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  39.05 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  40.1 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  41.75 
 
 		 394 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  39.85 
 
 		 412 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  32.92 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  38.27 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  34.9 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  39.95 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  42.56 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  37.61 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.4 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  42.71 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  36 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  33.69 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  37.78 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  35.96 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  41.16 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.27 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  38.52 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  37.29 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  38.77 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  33.59 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  38.77 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  34.11 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.21 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.5 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.21 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.21 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  33.85 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  36.78 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.21 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  33.95 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.16 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  31.95 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  37.43 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  35.42 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  37.47 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  31.35 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  36.82 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  37.74 
 
 		 410 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  32.08 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.4 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  34.63 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  37.22 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  36.63 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  32.1 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.42 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.75 
 
 		 711 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  31.4 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.45 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.99 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.56 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.17 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.53 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.88 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  31.82 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  32.37 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  31.83 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  32.37 
 
 		 422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.57 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  31.03 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>