More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3289 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  91.6 
 
 		 250 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  76.4 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  80.08 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  72 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  72.69 
 
 		 249 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  74.4 
 
 		 250 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 		 255 aa  293  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  57.87 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  57.09 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  57.89 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  55.6 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  55.47 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  55.47 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  54.44 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  50.59 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  53.94 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  53.63 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  56.38 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  52.8 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  50.58 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  54.66 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  46.56 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  51.55 
 
 		 258 aa  248  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  45.93 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  38.25 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.21 
 
 		 370 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.43 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.14 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  29.03 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.2 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.2 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.59 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  29.96 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.43 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.88 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.86 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.82 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.5 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  36.09 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27.41 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.82 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  31.47 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  34.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.44 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  34.96 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.44 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.27 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.93 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  27.93 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.51 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  35.77 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>