More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3115 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  92.93 
 
 
382 aa  722    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
382 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  87.96 
 
 
382 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  96.6 
 
 
382 aa  763    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 
388 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  72.16 
 
 
389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 
389 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  70.08 
 
 
391 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  69.25 
 
 
391 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  68.53 
 
 
388 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 
388 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  69.97 
 
 
385 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 
390 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  69.25 
 
 
387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  64.97 
 
 
395 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 
383 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  44.57 
 
 
389 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  43.65 
 
 
385 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.94 
 
 
380 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.64 
 
 
390 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  42.4 
 
 
383 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  42.4 
 
 
393 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  40.41 
 
 
402 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  40.41 
 
 
402 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.84 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.46 
 
 
383 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.53 
 
 
379 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.51 
 
 
383 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  39.64 
 
 
403 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.51 
 
 
383 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  42.7 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.15 
 
 
382 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  41.31 
 
 
390 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  41.04 
 
 
381 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.83 
 
 
379 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.44 
 
 
379 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  38.65 
 
 
383 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  40.16 
 
 
385 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.9 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  41.94 
 
 
384 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  40.16 
 
 
379 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  41.4 
 
 
390 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  39.83 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.83 
 
 
384 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.34 
 
 
380 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.41 
 
 
382 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  40 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  33.33 
 
 
403 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.32 
 
 
402 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.19 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.32 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.32 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.57 
 
 
389 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
390 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  35.85 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.83 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
387 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.8 
 
 
387 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.89 
 
 
390 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.22 
 
 
388 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 
386 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  33.16 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.94 
 
 
389 aa  165  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.62 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  34.13 
 
 
387 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.49 
 
 
381 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.87 
 
 
389 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.55 
 
 
387 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.64 
 
 
388 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.71 
 
 
397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.11 
 
 
388 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.38 
 
 
394 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.47 
 
 
387 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.98 
 
 
386 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  33.09 
 
 
402 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.87 
 
 
397 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.39 
 
 
383 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.33 
 
 
378 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  31.25 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  33.51 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.24 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.04 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.54 
 
 
390 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.79 
 
 
395 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 
392 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.26 
 
 
385 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.68 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  32.34 
 
 
388 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 
392 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.8 
 
 
388 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.8 
 
 
388 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.07 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.07 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  34.54 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.8 
 
 
388 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>