More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2997 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  63.16 
 
 		 529 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  65.84 
 
 		 500 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  73.97 
 
 		 491 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  65.01 
 
 		 496 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  68.4 
 
 		 485 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  91.44 
 
 		 509 aa  939    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  80.31 
 
 		 504 aa  792    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  81.53 
 
 		 510 aa  829    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  76.01 
 
 		 501 aa  750    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  75.83 
 
 		 499 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  94.36 
 
 		 514 aa  945    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  65.49 
 
 		 496 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  89.3 
 
 		 503 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 514 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  80.5 
 
 		 504 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  72.92 
 
 		 491 aa  724    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  65.96 
 
 		 490 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  65.07 
 
 		 496 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  66.8 
 
 		 509 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  72.9 
 
 		 503 aa  720    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 491 aa  727    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  74.58 
 
 		 500 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  76.47 
 
 		 491 aa  753    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  76.95 
 
 		 514 aa  788    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 491 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  66.4 
 
 		 496 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  65.01 
 
 		 496 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  63.9 
 
 		 493 aa  630  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  63.92 
 
 		 488 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  64.08 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  61.02 
 
 		 496 aa  611  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  62.61 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  61.52 
 
 		 517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  57.38 
 
 		 493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  56.39 
 
 		 497 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  57.2 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  57.85 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  57.73 
 
 		 487 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  57.73 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  56.57 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  56.79 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.95 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  55.11 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  53.62 
 
 		 476 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  51.55 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  55.04 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.48 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  55.04 
 
 		 481 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 		 461 aa  498  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 		 495 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.72 
 
 		 485 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  53.62 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  47.29 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  51.54 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  48.48 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  50.54 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  47.94 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 462 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  49.03 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.36 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.06 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 451 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>