More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2965 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  64.86 
 
 		 498 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  79 
 
 		 500 aa  796    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  86.8 
 
 		 500 aa  902    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  77.56 
 
 		 499 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  92.6 
 
 		 500 aa  922    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  81.56 
 
 		 499 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 500 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  79.4 
 
 		 500 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 		 497 aa  598  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  60.92 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  63.76 
 
 		 496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  62.66 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  60.76 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  56.96 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  59.03 
 
 		 542 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  58.02 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  60.96 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  56.59 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  58.2 
 
 		 497 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  58.37 
 
 		 497 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  62.01 
 
 		 497 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  56.39 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  58.37 
 
 		 497 aa  545  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  65.53 
 
 		 497 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  56.28 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  55.33 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  54.35 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  52.23 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  50.54 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  50.78 
 
 		 500 aa  435  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 500 aa  418  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 		 500 aa  415  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  50.31 
 
 		 514 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 489 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  48.55 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  45.82 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  52.67 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  47.03 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  45.47 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  45.47 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  46.44 
 
 		 533 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  41.48 
 
 		 508 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 		 510 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 		 518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.91 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 511 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 511 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  42.09 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  51.09 
 
 		 491 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  42.32 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.21 
 
 		 506 aa  342  7e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.23 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  44.1 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 		 515 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  43.61 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  44.59 
 
 		 496 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 		 491 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.17 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.35 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  49.1 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  43.64 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  47.57 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  46.51 
 
 		 496 aa  322  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  41.54 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.34 
 
 		 496 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  46.14 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  45.84 
 
 		 556 aa  319  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  41.92 
 
 		 495 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  42.75 
 
 		 507 aa  315  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  44 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 		 510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  42.82 
 
 		 498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 		 503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  43.87 
 
 		 510 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.35 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  44.74 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  52.56 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  43.34 
 
 		 536 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.25 
 
 		 503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  48.49 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.69 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.89 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.65 
 
 		 518 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  42.46 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  42.56 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.57 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.57 
 
 		 503 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  48.12 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>