More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2782 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
217 aa  433  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  89.4 
 
 
217 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3179  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  75.12 
 
 
217 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4410  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  70.95 
 
 
215 aa  304  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1794  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  69.67 
 
 
217 aa  296  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2521  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  70.14 
 
 
216 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0652814  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1773  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  69.19 
 
 
217 aa  284  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0590351  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.95 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
208 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
208 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
208 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.87 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53 
 
 
225 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.51 
 
 
208 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
208 aa  174  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.5 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.49 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1792  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
215 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.0332826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.47 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.27 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.57 
 
 
216 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
219 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.23 
 
 
219 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.49 
 
 
236 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.44 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  0.00000246992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.54 
 
 
218 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.55 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.55 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.55 
 
 
219 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.6 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.56 
 
 
220 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.6 
 
 
208 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
225 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491382  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
222 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.9 
 
 
211 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.94 
 
 
667 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1768  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.45 
 
 
219 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.597766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.15 
 
 
208 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  46.8 
 
 
226 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.45 
 
 
233 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.27 
 
 
223 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1546  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  46.56 
 
 
219 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
216 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0186  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.35 
 
 
428 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000467688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.59 
 
 
211 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1563  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.5 
 
 
211 aa  154  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.22 
 
 
224 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.19 
 
 
225 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.08 
 
 
211 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
208 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.99 
 
 
221 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.08 
 
 
211 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
394 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.56 
 
 
211 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.25 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.2 
 
 
219 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.93 
 
 
211 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.96 
 
 
221 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2419  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.06 
 
 
244 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03724  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.43 
 
 
211 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.32477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2523  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  46.73 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284795  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.69 
 
 
660 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.97 
 
 
226 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.79 
 
 
211 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48 
 
 
218 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.94 
 
 
216 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>