138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2765 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  84.21 
 
 		 96 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  83.33 
 
 		 96 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  75.53 
 
 		 96 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  76.19 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  68.24 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  49.4 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  45.98 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  42.11 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  48.31 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  44.83 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  44.32 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  45.65 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  39.13 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  38.54 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  39.29 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  40.91 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  40.66 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  43.02 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  43.04 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  37.93 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  43.18 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  40.23 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  44.09 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  47.83 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  39.33 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  43.24 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  40.22 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  50.57 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  38.37 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  38.64 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  39.18 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  39.08 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  39.36 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  31.87 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.08 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  32.14 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 834 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  34.15 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  44.93 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  34.83 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  40 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  40.96 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  43.86 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  40.51 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  41.86 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  35.23 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  31.25 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  43.86 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  35.63 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  43.28 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  30.61 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  35.35 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  37.78 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  37.36 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  37.5 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  38.55 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  31.58 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  29.87 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  31.65 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  31.58 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  37.08 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  40.74 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  35.94 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  33.77 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  38.18 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  30.49 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  31.33 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  35.23 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  30.26 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  29.41 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  29.41 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  42.11 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  36.21 
 
 		 377 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12480  predicted acetyltransferase  51.16 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  30.43 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  29.21 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  28.57 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  31.65 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  27.27 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  27.27 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>