50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2760 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  30.19 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  30.81 
 
 		 596 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  29.79 
 
 		 724 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  29.66 
 
 		 1141 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  25.78 
 
 		 934 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 994 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1911 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 644 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1621 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  31.85 
 
 		 1219 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  25.96 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  25.53 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  29.19 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  27.22 
 
 		 720 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  22.54 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  26 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  25.24 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1083 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  25 
 
 		 982 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  20.07 
 
 		 962 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1779 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  24.48 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1502 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 1363 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1544 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.13 
 
 		 992 aa  50.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 681 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1448 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  29.5 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 		 991 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  27.82 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  32.72 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1711 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1060 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  27.04 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 		 1266 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  29.45 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.56 
 
 		 837 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.53 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 725 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  28.83 
 
 		 325 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.23 
 
 		 816 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 909 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>