53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2626 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  95.65 
 
 		 263 aa  357  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  94.44 
 
 		 248 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  73.54 
 
 		 250 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  77.14 
 
 		 253 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  73.68 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  78.14 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  43.2 
 
 		 187 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  42.94 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  41.76 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  39.41 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  39.41 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  42.07 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  42.26 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  43.98 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  33.51 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  32.43 
 
 		 205 aa  99  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 219 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  34.1 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  32.1 
 
 		 209 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  31.48 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  30.25 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  27.06 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  30.28 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  26.09 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  26.47 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  26.35 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  22.91 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  22.91 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  27.72 
 
 		 176 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  24.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  27.62 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  27.03 
 
 		 172 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  30.95 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  21.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  27.48 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  22.77 
 
 		 172 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  23.47 
 
 		 166 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  24.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  23.47 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  22.77 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  23.08 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  21.78 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  22.54 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  28.48 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  22.45 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  30.34 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  21.78 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  21.19 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  19.8 
 
 		 186 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  20.79 
 
 		 203 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>