33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2578 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  decreased coverage  0.0015233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2893  hypothetical protein  74.19 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2852  hypothetical protein  79.48 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1827  hypothetical protein  59.64 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1435  hypothetical protein  51.85 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2569  hypothetical protein  62.76 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3946  hypothetical protein  51.06 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5431  hypothetical protein  74.32 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5238  hypothetical protein  70.27 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5879  hypothetical protein  69.12 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6496  hypothetical protein  69.12 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5160  hypothetical protein  66.22 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4695  hypothetical protein  66.22 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1474  hypothetical protein  34.11 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.656718  normal  0.108211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1673  hypothetical protein  32.32 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1570  hypothetical protein  32.3 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0939  hypothetical protein  32.71 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0946  hypothetical protein  32.71 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2242  hypothetical protein  32.17 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2684  hypothetical protein  36.55 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1150  hypothetical protein  55.22 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3005  hypothetical protein  34.22 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2149  hypothetical protein  43.04 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1689  hypothetical protein  49.28 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1004  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1724  hypothetical protein  43.55 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0136792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1797  hypothetical protein  55.81 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1782  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0185  hypothetical protein  47.92 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2263  hypothetical protein  55.81 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1095  hypothetical protein  55.26 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.86 
 
 		 2449 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  39.71 
 
 		 1888 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>