211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2554 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  80.15 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  71.64 
 
 		 282 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2545  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.67 
 
 		 281 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121468  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  55.69 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.21 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.28 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.06 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  27.5 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  27.5 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.76 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.05 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.71 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.24 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  30.63 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.25 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.74 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  40.87 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  33.14 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.94 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  31.79 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  31.79 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.86 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.56 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.38 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.72 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.09 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.82 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.69 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  34.74 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.34 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.86 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.25 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.74 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.15 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.45 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34.01 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.54 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.69 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.68 
 
 		 194 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.94 
 
 		 171 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.96 
 
 		 169 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.39 
 
 		 170 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.5 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.23 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 174 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  31.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1285  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.27 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.469864  hitchhiker  0.00228345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.26 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  35.35 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.04 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.37 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.36 
 
 		 157 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.45 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.62 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.12 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  43.08 
 
 		 170 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.82 
 
 		 182 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.18 
 
 		 221 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.08 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  38.33 
 
 		 439 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  45 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.79 
 
 		 199 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.94 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.35 
 
 		 194 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  35.29 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.81 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 180 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.73 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  34.48 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.54 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.54 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.66 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.36 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  46.38 
 
 		 480 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.65 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.21 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.02 
 
 		 499 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  34.44 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 438 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.96 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.56 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  35.29 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>