46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2549 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  91.06 
 
 		 247 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  59.67 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  57.56 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  57.14 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  55.42 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  56.96 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  44.77 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  43.93 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  49.75 
 
 		 544 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  35.93 
 
 		 231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  39.76 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  39.92 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  34.63 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  34.2 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  33.77 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  33.77 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  36.36 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  34.62 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  29.87 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  28.69 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  31.87 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  30.2 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  28.28 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  45 
 
 		 178 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  24.45 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  26.67 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  40 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  25.71 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  30.38 
 
 		 484 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  26.69 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  30.13 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  26.79 
 
 		 400 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  26.74 
 
 		 439 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  28.14 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  25.17 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  29.68 
 
 		 389 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  25 
 
 		 483 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  25.53 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  23.95 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  21.47 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  26.04 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>