107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2512 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1019 aa  1991    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  52.89 
 
 		 2407 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  51.92 
 
 		 814 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  50.49 
 
 		 1078 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  51.42 
 
 		 1111 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  50.42 
 
 		 1180 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  51.04 
 
 		 1130 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  54.08 
 
 		 882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.44 
 
 		 1081 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  53.41 
 
 		 987 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  45.37 
 
 		 907 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  36.79 
 
 		 1177 aa  264  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  38.46 
 
 		 678 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  48.48 
 
 		 190 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.21 
 
 		 1119 aa  105  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.86 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.2 
 
 		 816 aa  102  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.77 
 
 		 1011 aa  102  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 1782 aa  100  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.3 
 
 		 1333 aa  99  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  25.45 
 
 		 1519 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.28 
 
 		 1848 aa  93.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.13 
 
 		 1227 aa  93.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.87 
 
 		 2366 aa  91.3  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 2365 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 2346 aa  89  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  27.56 
 
 		 2396 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1881 aa  85.1  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 2371 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.61 
 
 		 1285 aa  81.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.52 
 
 		 1004 aa  80.5  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  25.73 
 
 		 1508 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  25.46 
 
 		 2003 aa  77.4  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  43.68 
 
 		 3391 aa  77  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  24.63 
 
 		 4248 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.45 
 
 		 1056 aa  74.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  24.32 
 
 		 983 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.46 
 
 		 3506 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 		 1550 aa  73.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  34.52 
 
 		 1459 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  27.47 
 
 		 3954 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.08 
 
 		 1028 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 		 4238 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  27.54 
 
 		 3822 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.65 
 
 		 2906 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  43.51 
 
 		 2578 aa  65.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.66 
 
 		 1369 aa  65.1  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  27.41 
 
 		 4238 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.49 
 
 		 3089 aa  64.3  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 980 aa  64.3  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.98 
 
 		 1322 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.13 
 
 		 1769 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  26.2 
 
 		 986 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.74 
 
 		 995 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.69 
 
 		 1458 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.35 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  25.07 
 
 		 1164 aa  62.4  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  23.94 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  25.09 
 
 		 1016 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  24.53 
 
 		 995 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.73 
 
 		 1741 aa  60.1  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.09 
 
 		 2363 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  31.77 
 
 		 1571 aa  59.7  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  24.66 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.8 
 
 		 3415 aa  58.9  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.8 
 
 		 3420 aa  58.9  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  23.75 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.62 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  40.74 
 
 		 2926 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  32.89 
 
 		 1971 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 		 1489 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  31.48 
 
 		 3504 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.65 
 
 		 3629 aa  55.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  30.38 
 
 		 2711 aa  55.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.62 
 
 		 960 aa  54.7  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  35.04 
 
 		 852 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1882 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  24.27 
 
 		 1156 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  37.68 
 
 		 1093 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  37.68 
 
 		 1093 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 1033 aa  52.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.37 
 
 		 1125 aa  52  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  23.27 
 
 		 1001 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.99 
 
 		 1179 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  52.46 
 
 		 1861 aa  50.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  36.43 
 
 		 994 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.37 
 
 		 965 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1530 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.71 
 
 		 1134 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.65 
 
 		 3322 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.07 
 
 		 641 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.31 
 
 		 1357 aa  48.5  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  25.64 
 
 		 1130 aa  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.1 
 
 		 1694 aa  47.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  26.98 
 
 		 911 aa  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  63.89 
 
 		 641 aa  47.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.36 
 
 		 763 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.35 
 
 		 774 aa  46.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  24.83 
 
 		 1012 aa  45.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>