266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2489 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  78 
 
 
199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  72.22 
 
 
200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  65.66 
 
 
200 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  51.81 
 
 
195 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  51.3 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  48.98 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  53.33 
 
 
201 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  44.27 
 
 
193 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  43.75 
 
 
193 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  41.56 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  37.56 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
197 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  42.05 
 
 
199 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  43.57 
 
 
1287 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  35.67 
 
 
192 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  35.67 
 
 
192 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.82 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  38.97 
 
 
195 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  34.15 
 
 
214 aa  84.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  34.15 
 
 
214 aa  84.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  29.94 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  35.07 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  34.65 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.85 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  33.55 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.87 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  34.17 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.94 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.4 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  34.21 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.15 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.26 
 
 
236 aa  58.2  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
221 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  28.23 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  38.6 
 
 
296 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.64 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.34 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  29.71 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
440 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.73 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  27.68 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
208 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
197 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
218 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  37.01 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  27.47 
 
 
226 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.43 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
442 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  32.73 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.23 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.73 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.37 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.73 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.73 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  31.9 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.73 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.9 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.45 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.9 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.9 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.9 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.73 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
348 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>