251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2436 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  87.45 
 
 		 255 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  82.75 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  76.47 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  77.25 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  71.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  78.57 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  50.57 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  56.85 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  45.77 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  48.03 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  46.81 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  46.72 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  45.49 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  44.88 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  47.41 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  47.11 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  47.56 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  44.58 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  44.83 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  42.47 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  42.47 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  43.56 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  42.97 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  38.21 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  39.21 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  39.21 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  42.04 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  42.04 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  38.21 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  38.21 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  38.74 
 
 		 205 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.28 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  33.19 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  34.82 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 209 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.2 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  38.64 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  38.64 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  29.77 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.39 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  36.93 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  35.85 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 		 210 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 535 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  30.42 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  33.5 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  33.5 
 
 		 207 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  33 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  33.5 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  33.5 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  31.48 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  28.26 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.21 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.21 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.19 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.81 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  24.9 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  23.41 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>