278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2302 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  81.98 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  75.89 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  73.96 
 
 		 288 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  50.95 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  45.42 
 
 		 289 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  45.42 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  44.07 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  52.19 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  43.6 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  39.08 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  38.06 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  37.93 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  37.96 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  38.15 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  37.73 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  39.08 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  35.64 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  37.8 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  40.98 
 
 		 302 aa  168  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  36.67 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  34.43 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  38.91 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  36.82 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  34.64 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  35.14 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  35.19 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  36.1 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  35.13 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  37.04 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  35.74 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  35.74 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  35.74 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  34.78 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  36.54 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  34.42 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  36.2 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  32.23 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  36.92 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  36.15 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.78 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  31.62 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  31.62 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  31.62 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  31.62 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  31.99 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  31.62 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  31.25 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  31.27 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  31.27 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  31.18 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  31.18 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  30.51 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  30.51 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  31.18 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  30.88 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  30.88 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  32.84 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  35.21 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  31.25 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  33.7 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  30.15 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  30.15 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  33.45 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  32.7 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  34.11 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  32.84 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  31.5 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  31.82 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  33.72 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  33.21 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  33.72 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  33.72 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  33.71 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  29.67 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  32.02 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  31.85 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  32.59 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  33.86 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  31.67 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  35.98 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  30.55 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  29.82 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  29.41 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  33.7 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  31.48 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  32.36 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  29.82 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  29.78 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  29.52 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  32.21 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  29.78 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  30.15 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  30.15 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  29.32 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>