More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2248 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  90.12 
 
 		 324 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.88 
 
 		 324 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  78.64 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  56.96 
 
 		 324 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.59 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.45 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.83 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  46.42 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.83 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  47.65 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  47.02 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.75 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.37 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.37 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  46.75 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.51 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  45.17 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.11 
 
 		 324 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.65 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.93 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  50.67 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.61 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.51 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.34 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  43.96 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.17 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  48.15 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  44.37 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.61 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  43.44 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.25 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.19 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.94 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.06 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.19 
 
 		 322 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  42.02 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.5 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.96 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 		 322 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.42 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.77 
 
 		 322 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  38.39 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.42 
 
 		 324 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>