174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2068 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 169 aa  339  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  84.02 
 
 		 169 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  76.69 
 
 		 166 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  72.08 
 
 		 166 aa  231  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  70.32 
 
 		 166 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  66.23 
 
 		 166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  69.93 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  56.17 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  50.32 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  54.78 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  37.91 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  35.14 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.86 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  34.87 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  34.21 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  29.53 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  28.86 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  28.29 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  33.33 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  27.33 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  30.26 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.19 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  36.62 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  29.53 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  32.65 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  32.65 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  32.65 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  31.15 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  35.48 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  33.11 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  28.4 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  32.65 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  27.67 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  25.36 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  27.7 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  27.81 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  23.49 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  30.22 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  29.5 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2661  acetyltransferase  28.39 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.037655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0123  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0105  acetyltransferase  31.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  25.4 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.833574  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6142  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.189087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  25.4 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  24.46 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6226  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0286732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1864  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>