46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2056 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  88.17 
 
 		 169 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  77.51 
 
 		 169 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  68.21 
 
 		 173 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  75.54 
 
 		 174 aa  220  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  71.33 
 
 		 169 aa  217  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  62.59 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  35.65 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  28.89 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  29.19 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  28.15 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  28.14 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  27.41 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  28.99 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  30.93 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  30.93 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  43.59 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  56.52 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  26.95 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  54.35 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  54.35 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  54.35 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  54.76 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  26.09 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  41.43 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  57.14 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  57.14 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  29.47 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  52.94 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  20 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  74.07 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  46.81 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06805  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.220512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  70.37 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  27.5 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  24.77 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  73.91 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>