27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1941 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  85.93 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  81.41 
 
 		 203 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  72.13 
 
 		 330 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  68.31 
 
 		 213 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  60.67 
 
 		 180 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  53.53 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  51.27 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  48.28 
 
 		 275 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  52.1 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  52.1 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  46.55 
 
 		 280 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  48.48 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  45.4 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  47.8 
 
 		 282 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  43.1 
 
 		 283 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  42.14 
 
 		 376 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  40.91 
 
 		 379 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  41.76 
 
 		 378 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  41.76 
 
 		 378 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  34.97 
 
 		 374 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  43.7 
 
 		 384 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  44.2 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  40.6 
 
 		 348 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  39.87 
 
 		 157 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  43.51 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  32.95 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>