More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1895 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  78.3 
 
 
574 aa  873  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  91.11 
 
 
592 aa  1036  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
574 aa  1129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  78.94 
 
 
581 aa  863  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  84.9 
 
 
576 aa  949  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  75.65 
 
 
575 aa  855  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  47.75 
 
 
571 aa  465  1e-130  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  47.07 
 
 
578 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
565 aa  243  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
566 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
566 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
566 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
595 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 
551 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 
548 aa  202  1e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  29.16 
 
 
541 aa  201  2e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
547 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
547 aa  199  8e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 
546 aa  199  1e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
558 aa  197  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
562 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
572 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  29.15 
 
 
720 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 
666 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 
566 aa  186  1e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 
561 aa  184  4e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
672 aa  183  9e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
773 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
575 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
656 aa  181  3e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.03 
 
 
697 aa  181  3e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
561 aa  181  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
666 aa  180  6e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  28.57 
 
 
572 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 
741 aa  177  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
674 aa  176  1e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
771 aa  176  1e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.93 
 
 
663 aa  176  1e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
424 aa  175  2e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
673 aa  174  3e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 
577 aa  174  4e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
668 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
762 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
566 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 
775 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 
671 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.56 
 
 
584 aa  167  7e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.31 
 
 
665 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
665 aa  166  1e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
665 aa  166  1e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
585 aa  164  4e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
659 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 
666 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
586 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
693 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.27 
 
 
682 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 
636 aa  160  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.39 
 
 
670 aa  160  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.85 
 
 
671 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
688 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.04486e-09  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 
567 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.38 
 
 
650 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  29.62 
 
 
659 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 
659 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
584 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
658 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
665 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.17 
 
 
567 aa  154  3e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  27.79 
 
 
575 aa  154  3e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 
666 aa  154  3e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 
584 aa  155  3e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
660 aa  154  3e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.8 
 
 
582 aa  153  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 
567 aa  153  9e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 
606 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
581 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  27.41 
 
 
658 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
664 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0190  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
562 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  27.69 
 
 
585 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  26.26 
 
 
556 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
664 aa  149  1e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
577 aa  149  2e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 
606 aa  148  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  28.79 
 
 
574 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
662 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 
457 aa  147  4e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2222  hypothetical protein  88.75 
 
 
83 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0138453  normal  0.531895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
667 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
584 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
659 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
613 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
586 aa  147  7e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
598 aa  146  8e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  26.91 
 
 
660 aa  146  8e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.14 
 
 
588 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 
674 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  27.39 
 
 
555 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 
598 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  31.21 
 
 
620 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>