More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1879 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3588  thiolase  96.31 
 
 		 379 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  89.68 
 
 		 379 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  100 
 
 		 379 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  90.24 
 
 		 379 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  95.51 
 
 		 379 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  75.4 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  68.17 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  57.96 
 
 		 383 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  41.54 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  42.22 
 
 		 384 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  42.11 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  43.16 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.68 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.95 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  43.31 
 
 		 383 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.27 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  39.74 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.27 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.06 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  41.73 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.58 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  40.48 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  41.84 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.79 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  41.08 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  40.31 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.48 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.49 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.6 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  40.21 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  39.64 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  41.13 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  39.29 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  39.53 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.17 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  38.07 
 
 		 391 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  40.66 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  37.9 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  38.86 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.69 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  38.95 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  38.54 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  35.82 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  32.52 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.47 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.36 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.59 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.46 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.42 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  31.54 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.16 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.77 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  32.51 
 
 		 406 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  37.66 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  31.81 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.2 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.71 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  32.64 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.77 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.58 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.49 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.41 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.14 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.14 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.63 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.27 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  29.83 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  31.71 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.16 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.41 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.81 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  31.09 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.38 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  28.93 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.17 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.55 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  32.26 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.44 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  29.31 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.02 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.32 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  29.18 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.55 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.15 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  29.35 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  30.53 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>