58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1846 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1846  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1947  hypothetical protein  89.34 
 
 		 272 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3621  hypothetical protein  90.44 
 
 		 272 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1666  hypothetical protein  81.62 
 
 		 271 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2883  hypothetical protein  78.68 
 
 		 272 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1097  hypothetical protein  68.48 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00235966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2125  hypothetical protein  67.32 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3292  hypothetical protein  66.15 
 
 		 271 aa  354  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1503  hypothetical protein  62.26 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1776  hypothetical protein  61.92 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2258  hypothetical protein  63.67 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4744  hypothetical protein  63.1 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3350  hypothetical protein  59.22 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.834671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4813  hypothetical protein  61.09 
 
 		 259 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4977  hypothetical protein  56.92 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3459  hypothetical protein  57.31 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5282  hypothetical protein  57.31 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2364  hypothetical protein  58.58 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2570  hypothetical protein  56.15 
 
 		 266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3969  hypothetical protein  59.41 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0539312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3550  hypothetical protein  59.41 
 
 		 257 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5125  hypothetical protein  58.58 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.039985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1597  hypothetical protein  54.47 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2576  hypothetical protein  57.74 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2200  protein of unknown function DUF1445  56.15 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37210  hypothetical protein  54.72 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00953297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2409  hypothetical protein  53.47 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.558045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3152  hypothetical protein  54.03 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.808227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1435  hypothetical protein  52.96 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3193  hypothetical protein  55.6 
 
 		 265 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0707  protein of unknown function DUF1445  54.94 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1142  hypothetical protein  52.63 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.585996  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0093  hypothetical protein  52.78 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01960  hypothetical protein  53.6 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5194  hypothetical protein  53.39 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0174  hypothetical protein  50.8 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3576  hypothetical protein  51.63 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0321  hypothetical protein  52.99 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5379  hypothetical protein  53.54 
 
 		 268 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.477329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3555  protein of unknown function DUF1445  52.78 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5849  hypothetical protein  52.89 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00315108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5735  hypothetical protein  51.84 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0498  hypothetical protein  51.39 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1731  hypothetical protein  50.62 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1103  hypothetical protein  51.88 
 
 		 263 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00199325  normal  0.0783421 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19220  hypothetical protein  51.15 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2449  hypothetical protein  52.67 
 
 		 270 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4424  hypothetical protein  49.4 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369265  normal  0.270561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3512  hypothetical protein  52.44 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2483  hypothetical protein  48.4 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0307873 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0337  protein of unknown function DUF1445  47.21 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13975  predicted protein  50 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0534  hypothetical protein  51.46 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.645229  normal  0.0111523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0610  hypothetical protein  48.54 
 
 		 260 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3393  hypothetical protein  45.63 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0256921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22470  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05290  conserved hypothetical protein  42.55 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2940  protein of unknown function DUF1445  64.08 
 
 		 137 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>