285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1844 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  91.33 
 
 		 415 aa  752    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  86.54 
 
 		 416 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  79.81 
 
 		 431 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 415 aa  847    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  77.83 
 
 		 416 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  70.05 
 
 		 422 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  67.16 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  50.61 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  50.61 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.33 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  50.61 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  51.33 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  52.58 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  50.87 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  52.33 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  48.32 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  50.99 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  49.76 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  50.12 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  48.56 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  48.43 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  47.92 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  49.64 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  47.9 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.15 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  49.88 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  50.24 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  47.43 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  47.36 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  47.76 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  49.39 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  48.56 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  47.19 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  48.42 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.41 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  49.51 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  48.31 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  48.65 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  47.72 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  50.37 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  48.89 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.4 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  47.43 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  48.33 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  50.12 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.28 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  48.28 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  46.72 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  47.42 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  46.96 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  48.28 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  48.28 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  49.63 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  47.42 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  50.12 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  50.12 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  49.51 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  48.41 
 
 		 426 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  49.25 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  47.28 
 
 		 421 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  49.01 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  47.06 
 
 		 418 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  48.43 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  49 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  47.03 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  46.83 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  46.96 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  47.03 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  47.03 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  47.03 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  47.68 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  46.06 
 
 		 412 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  49.5 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  47.55 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  48.39 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  45.57 
 
 		 413 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  45.75 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  47.91 
 
 		 415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  46.81 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  45.75 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  45.75 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  45.72 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  46.44 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  45.52 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  45.52 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  45.52 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  45.52 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  46.7 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>