281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1805 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1805  PfkB  100 
 
 		 318 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  94.24 
 
 		 300 aa  593  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  91.92 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  87.12 
 
 		 299 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  82.15 
 
 		 297 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  32.53 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.76 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  28.06 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  26.91 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.38 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.67 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.13 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 285 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  27.78 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  25.59 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  28.66 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  25.2 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  31 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  27.89 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  30.42 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  30.42 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  30.42 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  30.42 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  30.07 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  22.92 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  30.07 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  29.51 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  27.74 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.57 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  22.77 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  29.02 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  24.08 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  24.92 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  27.8 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  22.15 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  26.23 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  23.05 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  23.55 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.32 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.2 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  22.67 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  22.85 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  22.85 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  22.85 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  22.85 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  22.85 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  25.34 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  21.86 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  21.41 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  21.3 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  22.52 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  22.43 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  22.52 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  25.19 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  25.19 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  26.64 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.77 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  25.77 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  25.67 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  26.51 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  22.57 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  24.42 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  23.53 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  23.45 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  22.93 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  22.52 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  26.9 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  26.71 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  26.09 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  28.73 
 
 		 709 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  23.47 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.15 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  23.79 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  21.89 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  27.38 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  23.2 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  23.72 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  22.22 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  25.75 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>