More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1793 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  100 
 
 		 313 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  92.88 
 
 		 311 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  88.46 
 
 		 317 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  85.81 
 
 		 314 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.06 
 
 		 311 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  64.1 
 
 		 318 aa  414  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  69.4 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  63.58 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  62.83 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  62.91 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  60.53 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  60.07 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  63.61 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  61.59 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  61.18 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  62.46 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.39 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  60.26 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  60 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  59.48 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  60 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  61.39 
 
 		 316 aa  363  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  58.61 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  57.1 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  60.33 
 
 		 302 aa  344  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  57.43 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  59.04 
 
 		 691 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  46.59 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  49 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  45.45 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  46.67 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  47.42 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  46.33 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.93 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  46.62 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  47.87 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.37 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  44.52 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.45 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.09 
 
 		 324 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  43.93 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  46.36 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  41.69 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.85 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  43.99 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 		 340 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.51 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  39.87 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.6 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.27 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.57 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.52 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  40.27 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  51.34 
 
 		 510 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  51.56 
 
 		 512 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.79 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  49.09 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.98 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.19 
 
 		 311 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.31 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40.86 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.26 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  49.55 
 
 		 585 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  40.86 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  45.5 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.41 
 
 		 582 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  39.03 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.08 
 
 		 594 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 1171 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.53 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.75 
 
 		 581 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.5 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.93 
 
 		 576 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  44.7 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  47.17 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  47.75 
 
 		 580 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.41 
 
 		 667 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  40.39 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  42.71 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  36.84 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.96 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>