245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1755 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1755  BolA-like protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3710  BolA-like protein  97.44 
 
 
78 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1789  BolA family protein  97.4 
 
 
78 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1594  BolA-like protein  94.81 
 
 
78 aa  149  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5397  hypothetical protein  90.91 
 
 
79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  88.31 
 
 
77 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  87.01 
 
 
77 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  77.92 
 
 
78 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1276  BolA-like protein  77.92 
 
 
77 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  76.62 
 
 
78 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2390  BolA family protein  76.62 
 
 
77 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  75.32 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  75.32 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  74.03 
 
 
78 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  74.03 
 
 
78 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  74.03 
 
 
78 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  74.03 
 
 
77 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  75.32 
 
 
77 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  71.43 
 
 
77 aa  120  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  75.32 
 
 
77 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  72.73 
 
 
78 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  74.03 
 
 
78 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  70.13 
 
 
77 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  67.53 
 
 
78 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  68.42 
 
 
77 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  68.83 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  68.83 
 
 
77 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  64.94 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  63.64 
 
 
77 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  64.94 
 
 
77 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  68.49 
 
 
77 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  64.94 
 
 
77 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  62.34 
 
 
77 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  62.5 
 
 
80 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  63.16 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  57.5 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  58.75 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2952  BolA-like protein  58.75 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  54.55 
 
 
77 aa  94.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  55.26 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  50.65 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  50.65 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  56.16 
 
 
80 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  51.35 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  48.68 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  50 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  51.25 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  50.7 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  52.17 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  41.33 
 
 
80 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  50 
 
 
77 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  48.1 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  48.65 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1417  BolA family protein  50 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  49.3 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  48.57 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0490  hypothetical protein  42.67 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.529866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0700  BolA-like protein  42.11 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.088559  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0303  BolA family protein  39.47 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.321518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  40.54 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  41.33 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  41.33 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  44 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  42.67 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12011  BolA-like protein  46.27 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  44.16 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  42.67 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  45.45 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0204  BolA family protein  39.47 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0507648  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  42.11 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  40.54 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12161  BolA-like protein  39.44 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.458821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1121  BolA-like protein  36 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12171  BolA-like protein  41.79 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  40 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  40 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1611  BolA family protein  36.11 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  38.67 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  51.85 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  38.16 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  48.98 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  39.19 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  34.67 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  37.68 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  38.67 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  36.23 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  44.23 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  44.23 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  40 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  38.57 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0986  BolA-like protein  38.16 
 
 
73 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  41.07 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>