220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1745 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  88.56 
 
 
273 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  81.78 
 
 
272 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  65.41 
 
 
271 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.76 
 
 
271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  58.46 
 
 
274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  59.85 
 
 
274 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  57.41 
 
 
280 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  58.24 
 
 
275 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  56.65 
 
 
279 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  58.03 
 
 
276 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  58.46 
 
 
280 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  55.89 
 
 
279 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  56.02 
 
 
279 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  52.06 
 
 
276 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.94 
 
 
278 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.19 
 
 
276 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.92 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.35 
 
 
286 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  47.55 
 
 
276 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  47.43 
 
 
278 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.55 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  48.88 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  47.65 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  47.74 
 
 
274 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  51.65 
 
 
279 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  45.22 
 
 
278 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  49.06 
 
 
286 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  49.43 
 
 
286 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  49.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  49.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  43.77 
 
 
267 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  43.17 
 
 
276 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.84 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  41.79 
 
 
287 aa  188  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  46.33 
 
 
276 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  49.62 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  45.9 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  45.9 
 
 
274 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  49.05 
 
 
286 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  43.48 
 
 
281 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  43.56 
 
 
276 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  41.51 
 
 
275 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  42.02 
 
 
271 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.07 
 
 
284 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  42.01 
 
 
274 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  37.41 
 
 
288 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.08 
 
 
274 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  37.17 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.78 
 
 
268 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  32.09 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  37.07 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  39.48 
 
 
278 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.95 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  38.12 
 
 
255 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  32.1 
 
 
273 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  38.58 
 
 
289 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  31.32 
 
 
265 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  29.8 
 
 
258 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  35.71 
 
 
256 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  28.62 
 
 
289 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  34.69 
 
 
267 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  35.1 
 
 
282 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.87 
 
 
256 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  35.39 
 
 
274 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  33.88 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  35.4 
 
 
425 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  33.78 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  32.37 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  31.05 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  24.8 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  33.91 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  32.65 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.19 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  37.87 
 
 
253 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  36.93 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.6 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  33.62 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  36.4 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  34.14 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  32.24 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  37.45 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  34.69 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  34.75 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.53 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.68 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  31.68 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  34.11 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  30.6 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  36.33 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  30.12 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>