More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1648 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 361 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  82.37 
 
 		 347 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  72.67 
 
 		 353 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 		 306 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.27 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  39.9 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 1250 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.2 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  44.7 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.33 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  41.31 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 277 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.26 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  34.93 
 
 		 321 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  40.76 
 
 		 364 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  38.35 
 
 		 663 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.19 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  41.74 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 373 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 		 930 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 322 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.05 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.02 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.27 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 898 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 774 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 898 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 1035 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 1032 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 597 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.5 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 274 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  33.18 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0861  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0412  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0891  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0211715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  38.92 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>