207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1630 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  97.74 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  91.7 
 
 		 265 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  84.21 
 
 		 266 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  81.51 
 
 		 265 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  80.23 
 
 		 270 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  81.13 
 
 		 278 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  69.57 
 
 		 269 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  65.49 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  64.12 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  65.98 
 
 		 265 aa  345  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  65.18 
 
 		 286 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  61.57 
 
 		 301 aa  341  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  62.6 
 
 		 288 aa  341  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  66.25 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  63.78 
 
 		 270 aa  338  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  63.08 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  64.17 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  63.78 
 
 		 270 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  63.97 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  59.41 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  65.29 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  60.15 
 
 		 289 aa  321  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  58.94 
 
 		 286 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  58.69 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  58.69 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  57.68 
 
 		 309 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  59.45 
 
 		 310 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  60.08 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  60.42 
 
 		 322 aa  311  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  58.94 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  57.26 
 
 		 316 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  57.26 
 
 		 316 aa  304  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  56.42 
 
 		 325 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  57.61 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  56.25 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  55.38 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  55.6 
 
 		 332 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  53.64 
 
 		 355 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  55.51 
 
 		 268 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  54.3 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  53.41 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  53.82 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  54.3 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  53.41 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  54.3 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  53.23 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  53.23 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.88 
 
 		 312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.83 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  55.42 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  53.76 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  51.15 
 
 		 290 aa  284  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  51.31 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  53.33 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.6 
 
 		 273 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  55.04 
 
 		 270 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  50.19 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  51.36 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  54.2 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  51.56 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  49.37 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  52.87 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  53.28 
 
 		 265 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  51.97 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  53.28 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  49.81 
 
 		 274 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  50.19 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  51.92 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  49.61 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  52.52 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  47.58 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  48.82 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.82 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  44.26 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  48.56 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  46.33 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  42.69 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  42.15 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  41.51 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0044  metallophosphoesterase  48.18 
 
 		 363 aa  221  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  41.63 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  43.51 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  42.68 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 		 655 aa  209  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  43.88 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2538  metallophosphoesterase  42.74 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0823  metallophosphoesterase  42.32 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3659  metallophosphoesterase  39.1 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  39.92 
 
 		 357 aa  198  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  39.52 
 
 		 360 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  39.92 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5686  metallophosphoesterase  39.92 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  39.52 
 
 		 355 aa  195  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>