More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1619 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  100 
 
 		 332 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  91.87 
 
 		 332 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  90.48 
 
 		 331 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  83.44 
 
 		 345 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  82.87 
 
 		 346 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  83.87 
 
 		 334 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  80.86 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  68.2 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  37.05 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  39.51 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  37.7 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.95 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  36.42 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  35.02 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  34.97 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  37.58 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  34.57 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  34.17 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.17 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  39.51 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.18 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  34.15 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  34.08 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  36.1 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  34.49 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  33.64 
 
 		 335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  31.21 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  32.8 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  32.48 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  35.37 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.03 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  32.18 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  33.73 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  34.48 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.02 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  31.07 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  36.45 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.41 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  31.13 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.75 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  30.45 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  30.19 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.35 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  28.71 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.37 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.08 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.45 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  30.52 
 
 		 649 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  30.19 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30.19 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  39.68 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.73 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  35.27 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.97 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  29.87 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  32.63 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>