32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1506 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  48.15 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  37.41 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  42.06 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  33.06 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  25.24 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  29.84 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  32.31 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  29.41 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  25.81 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  27.18 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  26.06 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  27.45 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  23.81 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  33.75 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>