48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1455 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1455  DoxX  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  86.03 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  81.62 
 
 		 136 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  73.13 
 
 		 134 aa  203  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  52.27 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  51.52 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  51.69 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  50.77 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  47.76 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  49.23 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  48.46 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  47.01 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  49.61 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  50 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  49.19 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  48.48 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  44.44 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  47.58 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  42.22 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  44.53 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  45 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  42.28 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  41.86 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  45.04 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  38.4 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  36.88 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  42.28 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  39.17 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  40.62 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  38.66 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  38.06 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  37.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  35.2 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  34.11 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  36.59 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  36.15 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  34.62 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  37.4 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  38.17 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  38.35 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  36.23 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  37.59 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  37.59 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  37.59 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.25 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  30.3 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  43.33 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.77 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>