More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1351 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  42.37 
 
 		 892 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  86.11 
 
 		 907 aa  1558    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  50.78 
 
 		 891 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  42.94 
 
 		 892 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  58.29 
 
 		 902 aa  973    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 889 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  46.8 
 
 		 913 aa  763    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  42 
 
 		 897 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  56.42 
 
 		 918 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  93.94 
 
 		 907 aa  1645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  43.6 
 
 		 890 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  71.65 
 
 		 899 aa  1286    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  44.49 
 
 		 903 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  48.51 
 
 		 903 aa  757    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 893 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  55.14 
 
 		 906 aa  934    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 907 aa  1810    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 		 900 aa  652    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  47.29 
 
 		 893 aa  748    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  67.67 
 
 		 897 aa  1177    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 		 898 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 		 893 aa  713    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  50.55 
 
 		 900 aa  757    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  50.44 
 
 		 900 aa  755    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  68.34 
 
 		 897 aa  1177    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  50.06 
 
 		 900 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  56.28 
 
 		 907 aa  861    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  58.73 
 
 		 903 aa  1006    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  44.96 
 
 		 904 aa  716    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  43.76 
 
 		 893 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  46.68 
 
 		 897 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  41.61 
 
 		 911 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 		 898 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  39.39 
 
 		 895 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  42.52 
 
 		 929 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  40.36 
 
 		 911 aa  602  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  36.91 
 
 		 905 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 		 896 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  39.71 
 
 		 915 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  39.31 
 
 		 893 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  40.29 
 
 		 894 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  38.91 
 
 		 912 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 		 896 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  39.98 
 
 		 911 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  38.99 
 
 		 918 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 900 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  39.69 
 
 		 901 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 		 897 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  38.85 
 
 		 886 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  37.56 
 
 		 898 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  38.96 
 
 		 886 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  38.85 
 
 		 886 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  38.73 
 
 		 886 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 		 886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  38.85 
 
 		 886 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 		 886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  38.73 
 
 		 886 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  38.85 
 
 		 886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 913 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 904 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  38.55 
 
 		 886 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  37.36 
 
 		 921 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  39.17 
 
 		 913 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  39.21 
 
 		 887 aa  572  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  39.4 
 
 		 901 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  38.44 
 
 		 886 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  38.55 
 
 		 886 aa  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  38.35 
 
 		 920 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  38.84 
 
 		 903 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  38.44 
 
 		 886 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  39.17 
 
 		 901 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  38.44 
 
 		 886 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 901 aa  569  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  38.88 
 
 		 897 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 899 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 905 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  39.11 
 
 		 877 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  36.06 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  36.93 
 
 		 915 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  37.32 
 
 		 918 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  37.49 
 
 		 892 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  35.27 
 
 		 895 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  37.46 
 
 		 901 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  37.46 
 
 		 908 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 		 887 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 		 887 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  37.53 
 
 		 899 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 882 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  37.64 
 
 		 877 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 		 888 aa  538  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 		 904 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 		 882 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 880 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  36.98 
 
 		 892 aa  525  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  35.28 
 
 		 915 aa  524  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 		 880 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 		 882 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 880 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>