More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1350 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
168 aa  347  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  85.88 
 
 
171 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  86.15 
 
 
130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  72.86 
 
 
141 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  58.57 
 
 
141 aa  183  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  60 
 
 
146 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  63.11 
 
 
154 aa  173  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  57.45 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
144 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  40.85 
 
 
142 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
863 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  32.39 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.59 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
863 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  35.16 
 
 
863 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  28.03 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.34 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.71 
 
 
873 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.28 
 
 
897 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.53 
 
 
258 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.61 
 
 
433 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.75 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.14 
 
 
230 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  31.93 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.16 
 
 
863 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 
410 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
370 aa  61.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.2 
 
 
888 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
256 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
873 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.95 
 
 
859 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.47 
 
 
879 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.47 
 
 
879 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
888 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.23 
 
 
883 aa  58.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  33.02 
 
 
280 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.3 
 
 
282 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.05 
 
 
862 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.05 
 
 
859 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.35 
 
 
269 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  29.46 
 
 
287 aa  57.4  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  30.65 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.35 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  30.65 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  30.65 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  30 
 
 
378 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.54 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.2 
 
 
875 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  32.04 
 
 
258 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  24.77 
 
 
257 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  31.93 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.13 
 
 
880 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  27.63 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 
201 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  25.38 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
875 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.93 
 
 
580 aa  55.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.65 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
145 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 
246 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.47 
 
 
229 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 
279 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
391 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
391 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 
225 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  25.98 
 
 
149 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
431 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  24.59 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  27.41 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  31.16 
 
 
223 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
427 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 
859 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  24.39 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
230 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.63 
 
 
487 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
885 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  32.59 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.92 
 
 
867 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.56 
 
 
769 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.48 
 
 
331 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
279 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
428 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
279 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>